يقوم عمل المنظمة الفني أساسا على نظام اللجان المتخصصة التي يتم انتخاب أعضائها من قبل الجمعية العامة كل سنتين وذلك لبحث المواضيع المطروحة على أنظارها وإجراء الدراسات المتعلقة بتحقيق أهداف وأغراض المنظمة، وللمنظمة حاليا خمس لجان فنية، وتتألف كل لجنة من 9 دول أعضاء وتجتمع اللجنة مرتين في السنة على الأقل